Das ist eine leichte Sache
in der php.ini braucht man nur die Einstellung expose_php von On sprich 1 auf Off also 0 zu setzen.
Hierbei wird unterbunden das die PHP Version mit in die Server Signatur eingebunden wird.
Hier Anzeige mit expose_php 1
HTTP/1.1 200 OK
Date: Tue, 03 Mar 2009 13:56:47 GMT
Server: Apache/2.2.0 (Fedora)
X-Powered-By: PHP/5.2.0-8+etch13
und hier eine Ausgabe mit expose_php 0
HTTP/1.1 200 OK
Date: Tue, 03 Mar 2009 13:58:20 GMT
Server: Apache/2.2.9